La Direction est assurée par un Directeur nommé par décret pris en Conseil des ministres sur proposition du Ministre en charge du budget. Il a rang de directeur d'administration centrale. Il est l’animateur et le coordonnateur principal des activités de la DRBMGP. Il est assisté dans sa tâche par quatre (04) sous- directeurs nommés par arrêté du Ministre en charge du Budget.
Les Sous-Directions sont dirigées par des sous-directeurs nommés par arrêté. Ils ont rang de sous-directeur d'administration centrale. Le Directeur est également appuyé dans sa tâche par un assistant-formation, et un Intendant.
La Sous-Direction des Réformes des Traitements budgétaires et d'Appui aux Services administratifs est composée de deux services que sont : le Service des Traitements Budgétaires et le Service d’Appui aux Services Administratifs.
La Sous-Direction des Réformes des Traitements budgétaires et d'Appui aux Services administratifs est composée de deux services que sont : le Service des Traitements Budgétaires et le Service d’Appui aux Services Administratifs.
La Sous-direction de la Modernisation de la Gestion Publique est composée de deux services que sont : le Service de la Modernisation des Outils de Gestion et le service Appui à la mise en Œuvre des Budgets-Programmes.
La Sous-Direction de la Qualité et de la Normalisation est composée de deux services que sont : le service de la Qualité et le Service de l’Audit Qualité et Ecoute Clientèle.
Chaque service est dirigé par un Chef de Service nommé par décision du Directeur Générale du Budget et des Finances sur proposition du Directeur de la Réforme Budgétaire et de la Modernisation de la Gestion Publique.